Beasiswa mitra pendidikan merupakan beasiswa bantuan dana pendidikan oleh mitra Rumah ZIS UGM bagi mahasiswa/mahasiswi UGM yang memiliki kesulitan biaya pendidikan maupun kebutuhan pendukung perkuliahan. Beasiswa diberikan satu kali dengan besaran nominal antara Rp1.000.000,- sampai dengan Rp2.000.000,- menyesuaikan jumlah mahasiswa/mahasiswi yang lolos seleksi.
Pada pembukaan pertama Rumah ZIS UGM berkolaborasi dengan Rumah Amal Salman dan Asosiasi Masjid Kampus Indonesia (AMKI) sebagai donatur program. Diharapkan pada pembukaan sesi berikutnya bisa berkolaborasi dengan lebih banyak lembaga, organisasi, pemerintah, maupun industri lainnya.