Salah satu program penyaluran dana zakat, infaq, dan shodaqoh yang dikelola Rumah Zakat Infaq Shodaqoh (R-ZIS) UGM adalah beasiswa pelajar SD. Dalam hal ini R-ZIS dalam penyalurannya bekerja sama dengan SD Muhammadiyah Kolombo yang berlokasi di kompleks sekolah Kolombo. Beasiswa pendidikan dalam bentuk pemberian SPP penuh setiap bulan. Dikarenakan termasuk Sekolah Swasta, maka beban biaya sekolah masih belum sepenuhnya gratis.
Kerja sama ini sudah berlangsung selama 4 tahun dari penerima beasiswa bermula dari 5 anak hingga tahun ini menjadi 20 anak yang tersebar dari kelas 1 hingga kelas 6. Anak-anak penerima beasiswa ini semua berasal dari keluarga yang tidak mampu yang tinggal di sekitar Kali Gadjah Wong. Bahkan sebagian dari mereka merupakan anak yatim. Di tengah segala keterbatasan ini mereka tetap memiliki semangat dan cita-cita tinggi untuk sekolah sekaligus menimba ilmu agama sehingga mereka memilih untuk sekolah di SD Muhammadiyah Kolombo.